竖穴土坑墓的基本情况如下：

 墓葬形制方面：基本相同，大多作圆角长方形，个别呈椭圆形，无二层台竖穴土坑墓穴29座，有二层台竖穴土坑墓14座，值得注意的是，二层台墓葬的葬式均属二次扰乱葬，这说明二者有一定的关联。
埋葬习俗方面：以单人葬为主，共计27座，其中女性7人，男性10人，性别不明者10人；合葬墓9座，仅16号墓属三人葬，其余均为二人合葬墓；另有7座墓属迁葬墓。43座墓葬中均未发现使用葬具的痕迹。墓向较一致，都在北偏东或南偏西45°~75°之间，男女两性头向有别，一般男东女西。
 葬式方面：尕马台墓地的葬式十分特殊，除二次葬、迁葬、二次扰乱葬中的全身扰乱葬，因扰乱严重原葬式不知或难辨外，其余能分辨出原葬式的墓，皆为俯身葬。

在甘肃省和青海省的东部地区，新石器时代至青铜时代的葬式大体可分为仰身直肢葬、俯身直肢葬和屈肢葬，其中以仰身直肢葬为主，俯身葬被视为特殊葬式，但在尕马台墓地，可辨葬式全部采用俯身葬，这在齐家文化中为首次发现，在我国的史前文化中极为罕见。

      
      在以往发掘的齐家文化墓地中，如青海乐都柳湾、甘肃永靖秦魏家等墓地中，俯身葬所占比例极低，有的甚至无这一葬式的发现，如甘肃武威黄娘娘台和永靖大何庄墓地，相关学者经研究认为俯身葬可能代表了墓主人身份低下或死于非命。但在黄河上游的青海共和盆地，俯身葬则是当地流行并特有的葬式，这在宗日墓地中也有体现，俯身葬占到宗日墓葬总数的47％，这反映了俯身葬不同地区的丧葬制度中有着不同含义。

 此外，在尕马台墓地中还发现一座瓮棺葬，瓮棺直立于木坑中，葬具采用两件实用陶器相扣而成，棺内葬有一具约周岁的小孩骨架。